Filogenómica

Uno de los retos fundamentales de la Biología, e incluso uno de los sueños de Darwin, es llegar a comprender cómo se han constituído los genomas de todos los seres vivos. El uso de secuencias del genoma completo para reconstruir la historia evolutiva de los organismos, o filogenómica, debe llegar a ser muy útil para resolver no sólo el Árbol de la Vida, sino también para contestar muchas cuestiones importantes sobre desarrollo, metabolismo, patogénesis, fisiología o comportamiento.

Los estudios recientes han revelado el poder de la aproximación filogenómica, pero también sus retos, en particular la presencia de señales inconsistentes e incongruentes en los datos, y la enorme carga computacional asociada. Aunque en teoría la disponibilidad de nuevos genomas debe incrementar la resolución, tener más datos no es una panacea, y el error sistemático de una especificación equivocada de los modelos puede conducir a métodos filogenómicos que convergen en un árbol incorrecto, aunque aparentemente posea un fuerte apoyo estadístico. Se revisan las diferentes aproximaciones filogenómicas, resaltando sus ventajas y desventajas, y algunos de los problemas fundamentales que se necesita resolver en el futuro próximo, como el uso de modelos apropiados de evolución del genoma que, entre otras cosas, se enfrentan al problema de los árboles de genes y especies.

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